不登校の支援で使える助成金・補助金|フリースクールの利用料が保護者に出る11の自治体を、額と条件で並べた
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子どもがフリースクールに通い始めた。月謝が重い。自治体から助成金や補助金は出るのか。
そういう保護者に向けて、自治体の制度を並べます。
先に答えです。利用料の助成が保護者に出る自治体はあります。ただし、額と条件は自治体で大きく違います。
フリースクールの利用料に国が一律に出す助成金は、確かめた範囲で見当たりませんでした。住んでいる自治体の制度を調べることになります。
- 保護者に利用料が出る11の自治体の、額と主な条件
- 条件は3種類。施設の登録、出席扱い、欠席日数
- 「補助がある」と聞いても、施設に出る形の県や市がある
- 交通費を補助する県や市もある
- 住んでいる自治体の制度の調べ方

保護者に利用料が出る11の自治体
当サイトが、自治体の公式ページや要綱で1つずつ確かめた制度です。令和8年度の内容です。
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| 自治体 | 額 | 主な条件 |
|---|---|---|
| 東京都 | 月2万円まで | 所得制限なし。欠席日数の条件もなし |
| 足立区 | 都の助成に月2万円まで上乗せ | 都の交付決定が先に要る |
| 相模原市 | 月2万円まで(上限までは全額) | 市が登録した施設。オンラインだけの月は対象外 |
| 神戸市 | 半額。通所型は月2万円まで | 出席認定と、市の認定施設 |
| 名古屋市 | 4分の1、月1万1,000円まで | 所得制限なし。就学援助の世帯は半額 |
| 千葉市 | 月1万円まで(年6万円) | 市の登録施設と、出席扱い |
| 岡山市 | 半額、月1万円まで | 市の登録施設。授業日に通った分だけ |
| 松山市 | 半額、月1万円まで | 市の認定施設。欠席が年間30日以上 |
| 姫路市 | 半額、月1万円まで | 在籍校の校長による出席扱いの認定 |
| さくら市(栃木県) | 月1万円まで | 学校長と市の教育委員会が認めた施設 |
| 大阪市 | 月1万円まで(塾代助成) | 小学5年生から中学3年生。登録済みの施設 |
いちばん多い形は「半額で、月1万円まで」です。岡山市、松山市、姫路市がこの形でした。
東京都と相模原市は、月2万円までと額が大きい自治体です。足立区に住んでいれば、都と区を合わせて月4万円までになります。
大阪市の制度は、フリースクール専用ではありません。習い事や塾の費用への助成で、登録された施設なら使えます。
対象は、毎月の利用料が基本です。入会金や教材費、交通費は、対象外とする制度がほとんどでした。
条件は3種類ある
額より先に、条件を見てください。条件は、大きく3種類に分かれます。
1. 施設の登録・認定
自治体が登録や認定をした施設だけを対象にする形です。相模原市、神戸市、千葉市、岡山市、松山市がこの形です。
通いたい施設が一覧にないと、補助は出ません。一覧は、各自治体のページに載っています。
2. 出席扱いの認定
在籍校で出席扱いになっていることを条件にする形です。神戸市、千葉市、姫路市がこの形です。
この形の自治体では、学校への相談が先になります。姫路市は、出席扱いを「保護者が申請した日より後」と決めています。
出席扱いの仕組みは不登校の出席扱いにまとめました。
3. 欠席日数
年間30日以上の欠席を条件にする形です。松山市と姫路市は、対象を「年間30日以上欠席した不登校の小中学生」としています。
東京都と名古屋市には、欠席日数の条件がありません。
休み始めたばかりの時期は、この条件に届いていないことがあります。届く前の月の利用料は、対象になりません。
在籍する学校にも条件がある
多くの制度は、その自治体の公立の小中学校に在籍する子が対象です。私立や国立の学校に在籍する子は、対象から外れる制度があります。
月謝がいくらで、上限に届くか
「半額」の制度は、月謝が上限の2倍になると補助が増えなくなります。当サイトで計算しました。
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| 制度の形 | 上限に届く月謝 | それを超えた分 |
|---|---|---|
| 半額・月1万円まで | 月2万円 | 全額が自己負担 |
| 半額・月2万円まで | 月4万円 | 全額が自己負担 |
| 4分の1・月1万1,000円まで | 月4万4,000円 | 全額が自己負担 |
月謝が4万円のフリースクールに通う場合で比べます。
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| 制度の形 | 補助 | 自己負担 |
|---|---|---|
| 月2万円まで(東京都など) | 2万円 | 2万円 |
| 半額・月1万円まで | 1万円 | 3万円 |
フリースクールの費用の相場は不登校のフリースクールに書きました。
交通費を補助する県や市もある
利用料ではなく、通うための交通費を補助する県や市があります。
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仙台市は、市の教育支援センターに通う場合も対象です。
「補助がある」でも、保護者に出ない形がある
県や市に「フリースクールの補助がある」と聞いても、保護者に出るとは限りません。
施設に出る補助は、保護者の月謝が直接下がる仕組みではありません。
ただ、施設に出る補助には「出席扱いの実績」などの条件がついています。見学のときに「県や市の補助を受けていますか」と聞くと、1つの目安になります(当サイトの読み)。
神奈川県の補助は、市町村に出ます。その先で保護者に補助を出すかどうかは、市町村が決めます。相模原市の制度は、この仕組みを使っています。
補助がない自治体もある
利用料の補助がない、と答えている自治体もあります。
京都市と新潟市は、補助の代わりに、民間施設の一覧を公開しています。
住んでいる自治体の制度の調べ方
この記事に載っていない自治体にも、制度がある場合があります。調べる順番は次のとおりです。
- 「市区町村名 フリースクール 補助」で検索し、自治体の公式ページを開く
- 見つからなければ、「都道府県名 フリースクール 補助」でも調べる
- お金が出る先が、保護者か施設かを確かめる
- 保護者に出る制度なら、対象の施設と申請の期間を見る
制度は年度ごとに変わります。申請の期間が短い自治体も多いので、早めに確かめてください。
わからないときは、市区町村の教育委員会か、教育支援センターに聞けます。探し方は不登校の「支援センター」はどこ?に書きました。
家から参加できるオンラインのフリースクールも、通い先の候補になります。
申請の前に確かめる4つ

- お金が出る先(保護者か、施設か)
- 対象の施設(登録や認定が要る自治体がある)
- 出席扱いの条件(学校への相談が先になる)
- 申請の期間と領収書(期間が短い自治体が多い)
よくある質問
Q. 不登校の家庭に、国から助成金は出ますか。
A. フリースクールの利用料に国が一律に出す助成金は、確かめた範囲で見当たりませんでした。自治体ごとの制度です。
Q. 助成金は、いくらくらい出ますか。
A. 月1万円までの自治体が多く、東京都や相模原市は月2万円までです。
Q. どのフリースクールでも対象になりますか。
A. 自治体によります。登録や認定を受けた施設だけが対象の自治体があります。
Q. 入会金や教材費は対象ですか。
A. 対象外とする制度がほとんどでした。対象は毎月の利用料が基本です。
まとめ
- フリースクールの利用料が保護者に出る自治体はある。額と条件は自治体で違う
- いちばん多い形は「半額で、月1万円まで」。東京都と相模原市は月2万円まで
- 条件は3種類。施設の登録・認定、出席扱いの認定、欠席日数
- 県の補助は施設に出る形が多い。保護者の月謝が直接下がるわけではない
- 制度は年度ごとに変わる。住んでいる自治体の公式ページで確かめる
出典
- この記事の額と条件は、表からリンクした各自治体の記事で、自治体の公式ページ・要綱・募集要項をもとに確かめたものです。資料の名前と更新日は、各記事の出典に載せています
- さくら市「フリースクール等利用料助成金(令和8年度)」(2026年4月30日更新)。月額1万円の上限、助成対象施設
- 千葉市教育委員会「令和8年度 教育支援センター等活動費・通所費助成について」(2026年5月20日更新)、千葉県教育委員会「千葉県フリースクール活動支援事業の実施団体の募集について」(令和8年5月29日発表)。千葉市と千葉県の制度は千葉のフリースクールにも書いています
- 上限に届く月謝と自己負担の額は、当サイトで計算しました

